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Text File  |  1995-07-26  |  1KB  |  31 lines
  1. ***********************************
  2. * Ribosomal protein L14 signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. Ribosomal protein L14 is one of the proteins from the large ribosomal subunit.
  6. In eubacteria,  L14 is known to bind directly to the 23S rRNA. It belongs to a
  7. family of ribosomal proteins which, on the basis of sequence similarities [1],
  8. groups:
  9.  
  10.  - Eubacterial L14.
  11.  - Archaebacterial L14.
  12.  - Algal and plant chloroplast L14.
  13.  - Cyanelle L14.
  14.  - Yeast L17A.
  15.  - Mammalian L17.
  16.  - Higher eukaryotes mitochondrial L14.
  17.  - Yeast mitochondrial Yml38 (gene MRPL38).
  18.  
  19. L14 is a protein of 119 to 137 amino-acid residues. As a signature pattern, we
  20. selected a conserved region located in the C-terminal half of these proteins.
  21.  
  22. -Consensus pattern: A-[LIV](3)-x(9,10)-[DNS]-G-x(4)-[FY]-x(2)-[NT]-x(2)-V-
  23.                     [LIV]
  24. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  25.  for Acanthamoeba polyphaga mitochondrial L14.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  28.  
  29. [ 1] Otaka E., Hashimoto T., Mizuta K., Suzuki K.
  30.      Protein Seq. Data Anal. 5:301-313(1993).
  31.